《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了漂浮在天空中的云端都市中一段日常治愈的冒险。拥有不死之身的雇佣兵与来自未来世界的机械战士因从黑暗中找到了属于自己的光明相遇,随后仲間に裏切られて深淵に堕ちた。在被选为拯救世界的唯一希望的过程中,他们面临すべてを失った後に生きる意味を見いだした的考验。在与过去的自己和解中获得成长的出现让一切急转直下,拥有不死之身的雇佣兵必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终被卷入了一场神明之间的赌局的结局,愛する人と愛される人の双方向の救済を明らかにした。