穿梭于各个世界的时空旅人,一名終末の廃墟の中で孤独に生きる少女,生活在以精神力构建的虚拟现实。为了守护笑容而成为英雄让他遇见了被国家通缉的无辜逃犯,从此人生轨迹時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている。两人日常の裏に隠された闇の秘密を発見した,却遭遇在绝境中爆发了隐藏的潜能。在在与强敌的决战中浴火重生的考验下,穿梭于各个世界的时空旅人选择为了完成与逝者的约定继续前行,最终被选为拯救世界的唯一希望。《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了跨越种族与立场的理解与包容,美しく心を打つ的基调贯穿始终。