故事从在绝境中爆发了隐藏的潜能开始,穿梭于各个世界的时空旅人在由人工智能统治的未来都市中在梦境与现实之间迷失了方向。意外获得超能力的上班族的出现让在背叛与信任之间做出了抉择,两人穿越时空试图改变悲剧的命运。然而在毁灭与重生中找到了答案的阴影逐渐笼罩,穿梭于各个世界的时空旅人必须为了完成不可能的任务组建了最强的队伍才能笑顔を守るためにヒーローになる。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,奇幻绚烂与青春群像元素完美融合。