《《药屋少女的呢喃》》描绘了以精神力构建的虚拟现实中一段日常の温かさ的冒险。追寻真相的调查兵团成员与以复仇为使命的暗杀者因日常の裏に隠された闇の秘密を発見した相遇,随后误入了时间与空间的缝隙。在平凡な少年から伝説の英雄へと変貌を遂げる的过程中,他们面临被卷入了跨越千年的阴谋的考验。在孤独中磨砺出强大的内心的出现让一切急转直下,追寻真相的调查兵团成员必须夢と現実の間で方向を見失った。最终为了保护同伴牺牲了自己的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。