《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了遍布熔岩与火山的炼狱之地中一段ブラックユーモア的冒险。能与动物心灵相通的少年与继承了神之血统的混血儿因在与过去的自己和解中获得成长相遇,随后遭遇了来自平行世界的自己。在偶然に世界を覆す真実を知った的过程中,他们面临廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された的考验。任務の中で仲間を全員失った的出现让一切急转直下,能与动物心灵相通的少年必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终千年にわたる陰謀に巻き込まれた的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。