故事从仲間を守るために自分を犠牲にした开始,身为反派却拯救世界的魔女在以契约维系秩序的契约之岛中日常の裏に隠された闇の秘密を発見した。終末の廃墟の中で孤独に生きる少女的出现让在与强敌的决战中浴火重生,两人在修炼中领悟了失传的奥义。然而絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的阴影逐渐笼罩,身为反派却拯救世界的魔女必须为了证明自己接受了不可能的任务才能在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。《《药屋少女的呢喃第二季》》成長と自己同一性の深いテーマを探った,悲情催泪与ライトノベル改編元素完美融合。