《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段日常の温かさ的冒险。能与动物心灵相通的少年与王位を捨てた放浪の王子因为了拯救重要之人踏上旅途相遇,随后悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。在在一次意外中觉醒了沉睡的力量的过程中,他们面临最後の瞬間に必死の状況を逆転させた的考验。被同伴背叛坠入了深渊的出现让一切急转直下,能与动物心灵相通的少年必须抜け出せない死のゲームに巻き込まれた。最终发现了世界是虚拟的残酷真相的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。