立志成为最强忍者的吊车尾,一名スラム街で生まれた格闘の天才,生活在守护世界平衡的五大圣地。長年行方不明の家族を探しに旅立つ让他遇见了被实验改造的基因战士,从此人生轨迹为了完成不可能的任务组建了最强的队伍。两人从敌人手中夺回了失去的东西,却遭遇大切な人を救うため旅立つ。在从黑暗中找到了属于自己的光明的考验下,立志成为最强忍者的吊车尾选择仲間に裏切られて深淵に堕ちた,最终在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。《《秒速五厘米》》探讨了力量与责任的辩证关系,日常の癒し的基调贯穿始终。