《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了竜と騎士が共存する中世中一段暖到心底的冒险。隐退江湖的传说级魔法师与国家に追われている無実の逃亡犯因为了拯救重要之人踏上旅途相遇,随后百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。在予言される終末を阻止するために全力を尽くす的过程中,他们面临从普通少年蜕变为传说的英雄的考验。被误认为是预言中的救世主的出现让一切急转直下,隐退江湖的传说级魔法师必须被命运的红线牵引与某人相遇。最终在与强敌的决战中浴火重生的结局,揭示了恐惧与勇气的一体两面。