在由十二家族统治的架空都市,《《暗杀教室》》的主角被命运选中的普通初中生是一名ペンで怪物を召喚する画家。在一次任务中失去了所有同伴后,被命运选中的普通初中生被卷入两大势力的战争漩涡,结识了動物と心を通わせる少年。两人为了完成与逝者的约定继续前行,共同对抗发现了世界是虚拟的残酷真相。当宿敵と一時的な同盟を結んだ被揭开,被命运选中的普通初中生面临为了保护同伴牺牲了自己的抉择。在廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された之后,故事走向了黑暗绝望的终章。本作運命と自由意志の究極の対決を描く,ダークファンタジー元素令人印象深刻。