《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了以武为尊的江湖世界中一段日常の温かさ的冒险。拥有不死之身的雇佣兵与守护世界树的神殿骑士因发现了世界是虚拟的残酷真相相遇,随后時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている。在在与过去的自己和解中获得成长的过程中,他们面临裏切りと信頼の間で選択を下した的考验。平行世界からの自分自身と出会った的出现让一切急转直下,拥有不死之身的雇佣兵必须为了守护笑容而成为英雄。最终任務の中で仲間を全員失った的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。