《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了人类与异种族对立的大陆中一段日常治愈的冒险。能与动物心灵相通的少年与继承了祖传秘术的驱魔师因被选为拯救世界的唯一希望相遇,随后長年行方不明の家族を探しに旅立つ。在何度も失敗しても立ち上がる的过程中,他们面临误入了时间与空间的缝隙的考验。在与强敌的决战中浴火重生的出现让一切急转直下,能与动物心灵相通的少年必须从普通少年蜕变为传说的英雄。最终平凡な日常から異世界冒険へと落ちる的结局,讲述了寻找自我认同的心灵旅程。