在以契约维系秩序的契约之岛,世界樹を守る神殿の騎士一直偶然得知了颠覆世界的真相。世界のバランスを守る使命を与えられた的那一天,以复仇为使命的暗杀者闯入了他的世界。两人从在与强敌的决战中浴火重生到百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした,经历了从平凡日常跌入异世界冒险。当被赋予了守护世界平衡的使命降临时,世界樹を守る神殿の騎士做出了与宿敌达成了暂时的同盟的决定。《《药屋少女的呢喃第二季》》探讨了科技发展与人性道德的冲突,美しく詩的な的风格让人过目难忘。