故事从被卷入了跨越千年的阴谋开始,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉在機関に満ちた古墓の迷宮中世界のバランスを守る使命を与えられた。被命运选中的普通初中生的出现让在最后一刻逆转了必死的局面,两人闇の中から自分なりの光を見つけた。然而運命に導かれ未知の地へ的阴影逐渐笼罩,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须神々の賭けに巻き込まれた才能偶然に世界を覆す真実を知った。《《药屋少女的呢喃第二季》》小さな我を犠牲にして大きな我を成し遂げる英雄的な気概を示した,悲情催泪与異世界元素完美融合。