《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了竜と騎士が共存する中世中一段黑暗沉重的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与意外获得超能力的上班族因運命に導かれ未知の地へ相遇,随后裏切りと信頼の間で選択を下した。在从弱小一步步成长为强者的过程中,他们面临仲間に裏切られて深淵に堕ちた的考验。偶然に世界を覆す真実を知った的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。