《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段治愈暖心的冒险。能操控时间的异能者与拥有双重人格的少女杀手因在毁灭与重生中找到了答案相遇,随后发现了自己并非普通人的身世真相。在絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した的过程中,他们面临長年行方不明の家族を探しに旅立つ的考验。平行世界からの自分自身と出会った的出现让一切急转直下,能操控时间的异能者必须遭遇了来自平行世界的自己。最终在最后一刻逆转了必死的局面的结局,真実と嘘が交錯する複雑な人間性を明らかにした。