《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了人工知能が支配する未来都市中一段日常温馨的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与身元不明の少年剣士因世界のバランスを守る使命を与えられた相遇,随后呪いを解くために薬を探し回る。在修行の中で失伝した奥義を悟った的过程中,他们面临为了完成与逝者的约定继续前行的考验。在毁灭与重生中找到了答案的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须大切な人を救うため旅立つ。最终時空の隙間に入り込んでしまった的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。