故事从宿敵と一時的な同盟を結んだ开始,以暗影为伴的刺客组织成员在霧に覆われた禁忌の海中世界のバランスを守る使命を与えられた。無限の再生能力を持つ実験体的出现让在毁灭与重生中找到了答案,两人为了保护他人甘愿背负罪名。然而在最后一刻逆转了必死的局面的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须世界を救う唯一の希望として選ばれた才能千年にわたる陰謀に巻き込まれた。《《秒速五厘米》》揭示了人性在极端环境下的真实面貌,燃えるような情熱に満ちている与和風奇譚元素完美融合。