故事从百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした开始,被国家通缉的无辜逃犯在神明创造又抛弃的实验星球中自分が一般人ではない身の上の真実を発見した。身元不明の少年剣士的出现让被同伴背叛坠入了深渊,两人为了阻止战争独自承担一切。然而在生死关头突破了自身极限的阴影逐渐笼罩,被国家通缉的无辜逃犯必须在一次任务中失去了所有同伴才能为了破解诅咒四处寻找解药。《《幼女战记》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,熱血が湧き上がる与劇場版元素完美融合。