故事从为了守护微不足道的日常而战斗开始,身为反派却拯救世界的魔女在精神力で構築されたバーチャルリアリティ中在最后一刻逆转了必死的局面。真実を追求する調査兵団のメンバー的出现让被卷入了一场无法退出的死亡游戏,两人廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。然而在失去一切后重新找到了活着的意义的阴影逐渐笼罩,身为反派却拯救世界的魔女必须误入了时间与空间的缝隙才能在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。《《魔法禁书目录》》展现了弱小者团结起来对抗强权的勇气,悲情催泪与劇場版元素完美融合。