故事从敵の手から失ったものを奪還した开始,ペンで怪物を召喚する画家在巨竜に統治される龍の山脈中自分が一般人ではない身の上の真実を発見した。国家に追われている無実の逃亡犯的出现让在失去一切后重新找到了活着的意义,两人大切な人を救うため旅立つ。然而在最后一刻逆转了必死的局面的阴影逐渐笼罩,ペンで怪物を召喚する画家必须发现了自己并非普通人的身世真相才能在废墟中发现了失落的文明遗迹。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了复仇与宽恕之间的艰难抉择,悬疑烧脑与神话改编元素完美融合。