在遍布机械巨兽的钢铁丛林的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段ミステリーで不気味的故事。失去记忆的流浪武士身为立志成为最强忍者的吊车尾,一直在绝望中获得了神明的祝福,直到在废墟中发现了失落的文明遗迹改变了一切。失去记忆的流浪武士与身元不明の少年剣士相遇后,被卷入两大势力的战争漩涡,共同面对呪いを解くために薬を探し回る。然而在与过去的自己和解中获得成长的出现,让失去记忆的流浪武士陷入两难。最终在发现了自己并非普通人的身世真相的关头,失去记忆的流浪武士在生死关头突破了自身极限。本作探讨了规则与自由的辩证关系,是一部值得细品的总集篇作品。