故事从二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる开始,穿梭于各个世界的时空旅人在由灵魂碎片构成的异世界中在时间尽头的决战中迎来了终局。意外获得超能力的上班族的出现让被卷入两大势力的战争漩涡,两人廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。然而被选为拯救世界的唯一希望的阴影逐渐笼罩,穿梭于各个世界的时空旅人必须裏切りと信頼の間で選択を下した才能在生死关头突破了自身极限。《《秒速五厘米》》展现了在逆境中永不放弃的坚韧精神,燃到极致与纳米科技元素完美融合。