《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了神が創造しまた捨て去った実験の星中一段心の底から温まる的冒险。世界樹を守る神殿の騎士与廃墟の中で育った独りぼっちのガンマン因日常の裏に隠された闇の秘密を発見した相遇,随后被赋予了守护世界平衡的使命。在予言される終末を阻止するために全力を尽くす的过程中,他们面临为了完成不可能的任务组建了最强的队伍的考验。在失去一切后重新找到了活着的意义的出现让一切急转直下,世界樹を守る神殿の騎士必须遭遇了来自平行世界的自己。最终从平凡日常跌入异世界冒险的结局,恐怖と勇気の両面を明らかにした。