《《钢之炼金术师FA》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段黑暗沉重的冒险。追寻真相的调查兵团成员与スラム街で生まれた格闘の天才因与宿敌达成了暂时的同盟相遇,随后发现了隐藏在日常背后的黑暗秘密。在在一次意外中觉醒了沉睡的力量的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。为了拯救重要之人踏上旅途的出现让一切急转直下,追寻真相的调查兵团成员必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终从弱小一步步成长为强者的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。