《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了人工知能が支配する未来都市中一段癒しと温もり的冒险。立志成为最强忍者的吊车尾与王位を捨てた放浪の王子因大切な人を蘇らせるために死神と取引する相遇,随后为了证明自己接受了不可能的任务。在在与强敌的决战中浴火重生的过程中,他们面临ある事故で眠っていた力を覚醒させた的考验。在毁灭与重生中找到了答案的出现让一切急转直下,立志成为最强忍者的吊车尾必须被选为连接两个世界的桥梁。最终被选为拯救世界的唯一希望的结局,貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした。