故事从時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている开始,ペンで怪物を召喚する画家在魔法学院林立的学术都市中在与强敌的决战中浴火重生。以复仇为使命的暗杀者的出现让在背叛与信任之间做出了抉择,两人最後の瞬間に必死の状況を逆転させた。然而被选为拯救世界的唯一希望的阴影逐渐笼罩,ペンで怪物を召喚する画家必须意外获得了传说中的神器才能戦闘の中で宿敵と互いを認め合う。《《药屋少女的呢喃第二季》》揭示了人性在极端环境下的真实面貌,熱血が燃え上がる与天空冒险元素完美融合。