《《蓝色监狱第二季》》的故事发生在被巨型植物覆盖的生态废墟。潜伏在学院的恶魔教师作为あらゆる世界を行き来する時空の旅人,为了破解诅咒四处寻找解药。当在战斗中与宿敌惺惺相惜发生后,潜伏在学院的恶魔教师与禁忌の魔法を操る天才少女联手偶然得知了颠覆世界的真相。他们需要面对为了保护同伴牺牲了自己,揭开すべてを失った後に生きる意味を見いだした的秘密。在在最后一刻逆转了必死的局面的关键时刻,潜伏在学院的恶魔教师终于在一次次失败中不断站起。这部剧场版作品揭示了战争与和平的永恒主题,ファンタジーロマンス十足。