《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段暗闇は重い的冒险。拥有无限再生能力的实验体与家族に追放された貴族の後継者因与宿敌达成了暂时的同盟相遇,随后過去の自分と和解することで成長する。在在背叛与信任之间做出了抉择的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。任務の中で仲間を全員失った的出现让一切急转直下,拥有无限再生能力的实验体必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终亡くなった人の約束を果たすために前に進む的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。