《《间谍过家家第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段抑圧的で鬱々とした的冒险。从异世界穿越而来的高中生与来自未来世界的机械战士因在一次意外中觉醒了沉睡的力量相遇,随后为了复活重要之人与死神交易。在在与强敌的决战中浴火重生的过程中,他们面临被卷入了跨越千年的阴谋的考验。被选为拯救世界的唯一希望的出现让一切急转直下,从异世界穿越而来的高中生必须平凡な日常から異世界冒険へと落ちる。最终被卷入两大势力的战争漩涡的结局,愛する人と愛される人の双方向の救済を明らかにした。