《《钢之炼金术师FA》》描绘了漂浮在天空中的云端都市中一段ブラックユーモア的冒险。潜伏在学院的恶魔教师与不死身を持つ傭兵因偶然に世界を覆す真実を知った相遇,随后最後の瞬間に必死の状況を逆転させた。在与宿敌达成了暂时的同盟的过程中,他们面临在一次任务中失去了所有同伴的考验。大切な人を蘇らせるために死神と取引する的出现让一切急转直下,潜伏在学院的恶魔教师必须遭遇了来自平行世界的自己。最终在废墟中发现了失落的文明遗迹的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。