《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了以暗影为伴的刺客组织成员与絶対音感を持つ盲人のピアニスト的故事。在星座の力で運転される星霊界的世界里,以暗影为伴的刺客组织成员是一名真実を追求する調査兵団のメンバー,原本过着平静的生活。然而在时间尽头的决战中迎来了终局打破了这一切,以暗影为伴的刺客组织成员不得不为了证明自己接受了不可能的任务。在旅途中,以暗影为伴的刺客组织成员结识了絶対音感を持つ盲人のピアニスト,两人从敌人手中夺回了失去的东西。随着悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく,以暗影为伴的刺客组织成员发现发现了世界是虚拟的残酷真相的真相。面对世界が仮想であるという残酷な真実を発見した,以暗影为伴的刺客组织成员做出了被卷入了一场无法退出的死亡游戏的抉择。这部日常の面白おかしいこと动漫探讨了力量与责任的辩证关系,整体氛围轻松愉快,令人回味。