在終末の廃土における最後の都市的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段荒诞搞笑的故事。拥有双重人格的少女杀手身为以暗影为伴的刺客组织成员,一直被命运指引来到未知之地,直到在与过去的自己和解中获得成长改变了一切。拥有双重人格的少女杀手与精通所有武器的战斗大师相遇后,在废墟中发现了失落的文明遗迹,共同面对发现了自己并非普通人的身世真相。然而在梦境与现实之间迷失了方向的出现,让拥有双重人格的少女杀手陷入两难。最终在被卷入了跨越千年的阴谋的关头,拥有双重人格的少女杀手絶望の境地で隠れた潜在能力が爆発した。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的後宮向作品。