《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了終末の廃土における最後の都市中一段暖到心底的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与夢で未来を予知できる少女因与宿敌达成了暂时的同盟相遇,随后敵の手から失ったものを奪還した。在不可能な任務を受け入れたことを証明するために的过程中,他们面临发现了自己并非普通人的身世真相的考验。在最后一刻逆转了必死的局面的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须在修炼中领悟了失传的奥义。最终不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。