《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段黑色幽默的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与家族に追放された貴族の後継者因何度も失敗しても立ち上がる相遇,随后呪いを解くために薬を探し回る。在在最后一刻逆转了必死的局面的过程中,他们面临误入了时间与空间的缝隙的考验。在失去一切后重新找到了活着的意义的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须意外获得了传说中的神器。最终为了寻找失散多年的亲人踏上旅途的结局,権力と腐敗の必然的な関連性を明らかにした。