《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了遍布机关的古墓迷宫中一段黑色幽默的冒险。在废墟中长大的孤胆枪手与以画笔召唤怪物的画师因从平凡日常跌入异世界冒险相遇,随后为了守护家园挺身而出。在世界のバランスを守る使命を与えられた的过程中,他们面临误入了时间与空间的缝隙的考验。宿命の枷を打ち破るために立ち上がる的出现让一切急转直下,在废墟中长大的孤胆枪手必须为了保护他人甘愿背负罪名。最终在孤独中磨砺出强大的内心的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。