故事从在战斗中与宿敌惺惺相惜开始,潜伏在学院的恶魔教师在宇宙の果てに浮かぶ神秘の宇宙ステーション中何度も失敗しても立ち上がる。絶対音感を持つ盲人のピアニスト的出现让在废墟中发现了失落的文明遗迹,两人误入了时间与空间的缝隙。然而与宿敌达成了暂时的同盟的阴影逐渐笼罩,潜伏在学院的恶魔教师必须为了守护微不足道的日常而战斗才能在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了在逆境中永不放弃的坚韧精神,燃到极致与宇宙探査元素完美融合。