《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了寄生兽横行的末日世界中一段美しく心を打つ的冒险。守护家族的独眼武士与以复仇为使命的暗杀者因为了保护同伴牺牲了自己相遇,随后在绝望中获得了神明的祝福。在何度も失敗しても立ち上がる的过程中,他们面临仲間を守るために自分を犠牲にした的考验。絶望の中で神の祝福を得た的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。