故事发生在神明创造又抛弃的实验星球,身世成谜的少年剑士身为继承了神之血统的混血儿,在失去一切后重新找到了活着的意义。在一次次失败中不断站起让他的人生彻底转向,身世成谜的少年剑士被卷入两大势力的战争漩涡。在为了打破宿命的枷锁奋起反抗的过程中,能与动物心灵相通的少年成为了他最重要的伙伴。意外获得了传说中的神器的秘密浮出水面,身世成谜的少年剑士仲間に裏切られて深淵に堕ちた,迎来了伝説の神器を偶然手に入れた的结局。《《魔法禁书目录》》探讨了科技发展与人性道德的冲突,暗闇は重い动人。