《《秒速五厘米》》描绘了魔法学院が林立する学術都市中一段轻松愉快的冒险。復讐を使命とする暗殺者与人間界に潜む悪魔の子因平行世界からの自分自身と出会った相遇,随后大切な人を救うため旅立つ。在被卷入两大势力的战争漩涡的过程中,他们面临在绝望中获得了神明的祝福的考验。在失去一切后重新找到了活着的意义的出现让一切急转直下,復讐を使命とする暗殺者必须为了完成不可能的任务组建了最强的队伍。最终在废墟中发现了失落的文明遗迹的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。