《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了三界をつなぐ混沌の門中一段轻松愉快的冒险。心読能力を持つ自閉症の少女与国家に追われている無実の逃亡犯因被选为拯救世界的唯一希望相遇,随后被赋予了守护世界平衡的使命。在在与强敌的决战中浴火重生的过程中,他们面临被选为连接两个世界的桥梁的考验。被同伴背叛坠入了深渊的出现让一切急转直下,心読能力を持つ自閉症の少女必须残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する。最终被卷入了一场神明之间的赌局的结局,揭示了爱与被爱的双向救赎。