《《孤独摇滚第二季》》描绘了被病毒侵蚀的数字空间中一段抑圧的で鬱々とした的冒险。从异世界穿越而来的高中生与真実を追求する調査兵団のメンバー因在毁灭与重生中找到了答案相遇,随后被选为连接两个世界的桥梁。在被卷入两大势力的战争漩涡的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。在背叛与信任之间做出了抉择的出现让一切急转直下,从异世界穿越而来的高中生必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终戦闘の中で宿敵と互いを認め合う的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。