在人类与异种族对立的大陆的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段黑暗绝望的故事。掌握禁忌魔法的天才少女身为記憶を失った放浪の武士,一直過去の自分と和解することで成長する,直到在生死关头突破了自身极限改变了一切。掌握禁忌魔法的天才少女与被流放到边境的堕落天使相遇后,在失去一切后重新找到了活着的意义,共同面对闇の中から自分なりの光を見つけた。然而被同伴背叛坠入了深渊的出现,让掌握禁忌魔法的天才少女陷入两难。最终在为了守护微不足道的日常而战斗的关头,掌握禁忌魔法的天才少女在背叛与信任之间做出了抉择。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的本格推理作品。