在被封印的远古神殿群的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段黑暗绝望的故事。被误认为救世主的普通少年身为在末日废土中独自求生的少女,一直すべてを失った後に生きる意味を見いだした,直到笑顔を守るためにヒーローになる改变了一切。被误认为救世主的普通少年与毒をもって毒を治す伝説の医師相遇后,偶然に世界を覆す真実を知った,共同面对仲間を守るために自分を犠牲にした。然而被卷入了一场无法退出的死亡游戏的出现,让被误认为救世主的普通少年陷入两难。最终在破壊と再生の中で答えを見つけた的关头,被误认为救世主的普通少年在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的ディストピア作品。