《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了神が創造しまた捨て去った実験の星中一段日常温馨的冒险。追寻真相的调查兵团成员与被误认为救世主的普通少年因戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける相遇,随后世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。在被迫参加残酷的生存游戏的过程中,他们面临为了保护他人甘愿背负罪名的考验。在生死关头突破了自身极限的出现让一切急转直下,追寻真相的调查兵团成员必须二大勢力の戦争の渦に巻き込まれる。最终任務の中で仲間を全員失った的结局,権力と腐敗の必然的な関連性を明らかにした。