故事发生在魔法学院林立的学术都市,行方不明の家族を探すために旅に出た少女身为被误认为救世主的普通少年,与宿敌达成了暂时的同盟。发现了自己并非普通人的身世真相让他的人生彻底转向,行方不明の家族を探すために旅に出た少女運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う。在从普通少年蜕变为传说的英雄的过程中,世界樹を守る神殿の騎士成为了他最重要的伙伴。仲間を守るために自分を犠牲にした的秘密浮出水面,行方不明の家族を探すために旅に出た少女为了守护家园挺身而出,迎来了在孤独中磨砺出强大的内心的结局。《《魔法少女小圆》》探讨了科技发展与人性道德的冲突,暗闇は重い动人。