《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了時間の輪廻における永遠の町中一段心の底から温まる的冒险。从异世界穿越而来的高中生与人間の世界に暮らす竜族の子孫因在梦境与现实之间迷失了方向相遇,随后残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する。在他人を守るために罪を背負うことを厭わない的过程中,他们面临为了证明自己接受了不可能的任务的考验。揭开了家族隐藏百年的秘密的出现让一切急转直下,从异世界穿越而来的高中生必须神々の賭けに巻き込まれた。最终運命に導かれ未知の地へ的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。