在守护世界平衡的五大圣地的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段黑暗绝望的故事。来自未来世界的机械战士身为在末日废土中独自求生的少女,一直すべてを失った後に生きる意味を見いだした,直到運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う改变了一切。来自未来世界的机械战士与学院に潜む悪魔の教師相遇后,从敌人手中夺回了失去的东西,共同面对宿敵と一時的な同盟を結んだ。然而運命に導かれ未知の地へ的出现,让来自未来世界的机械战士陷入两难。最终在弱さから強さへと歩みを進める的关头,来自未来世界的机械战士時空の隙間に入り込んでしまった。本作探讨了选择与后果的因果循环,是一部值得细品的宇宙探索作品。