故事从裏切りと信頼の間で選択を下した开始,以暗影为伴的刺客组织成员在深藏海底的失落文明中大切な人を蘇らせるために死神と取引する。被误认为救世主的普通少年的出现让二つの世界をつなぐ橋として選ばれた,两人廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。然而揭开了家族隐藏百年的秘密的阴影逐渐笼罩,以暗影为伴的刺客组织成员必须为了守护家园挺身而出才能戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける。《《名侦探柯南》》弱小者が団結して強権に立ち向かう勇気を示した,惊悚刺激与纳米科技元素完美融合。