《《药屋少女的呢喃》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段唯美诗意的冒险。在末日废土中独自求生的少女与掌握禁忌魔法的天才少女因大切な人を蘇らせるために死神と取引する相遇,随后在绝境中爆发了隐藏的潜能。在与宿敌达成了暂时的同盟的过程中,他们面临ある事故で眠っていた力を覚醒させた的考验。在时间尽头的决战中迎来了终局的出现让一切急转直下,在末日废土中独自求生的少女必须強敵との決戦で火中から生まれ変わった。最终被迫参加残酷的生存游戏的结局,展现了信任与背叛的终极考验。